Alternative Splicing 조절에서 RNA 결합 단백질(RBP)의 3차원 구조 인식 메커니즘과 그 한계

Alternative splicing은 하나의 유전자에서 여러 종류의 다양한 mRNA 이소형체를 만들어내는 현상으로, 이는 유전자 발현 조절의 핵심 기전이지만, 이 과정에 관여하는 RNA 결합 단백질(RBP)들의 복잡한 구조적 인식 메커니즘은 여전히 활발히 연구되는 분야입니다.

RBP의 구조적 인식과 조절

• RBP는 단순히 염기 서열을 인식하는 것을 넘어, pre-mRNA의 이차 구조(secondary structure)나 특정 구조적 모티프와의 입체적 상호작용을 통해 스플라이싱 기구를 모집하거나 억제하는 것으로 알려져 있습니다.
• 최근 연구들은 특정 RBP들이 Exonic Splicing Enhancer (ESE) 또는 Intronic Splicing Silencer (ISS) 부위를 인식할 때, 해당 부위의 국소적인 DNA/RNA 구조적 왜곡에 의해 그 결합 친화도가 크게 영향을 받는다는 점을 밝혀냈습니다.